<ol id="pblvd"></ol>
      <cite id="pblvd"></cite>
      <font id="pblvd"><video id="pblvd"></video></font>
      <address id="pblvd"><rp id="pblvd"></rp></address>

        <p id="pblvd"></p>

          English | 中文版 | 手機版 企業登錄 | 個人登錄 | 郵件訂閱
          高級搜索
          當前位置 > 首頁 > 行業資訊 > 新聞 > JAX GeneWeaver系統:小鼠大數據助力衰老模型研究
          JAX GeneWeaver系統:小鼠大數據助力衰老模型研究
          點擊次數:169 發布日期:2022-5-9  來源:杰克森實驗室
          小鼠大數據,從此數據收集不用愁!
           
          衰老目前已經成為
          人類大量疾病風險性最高的誘因
          因此,積極推動衰老創新性基礎研究

          對于深入了解衰老發生機制
          延緩人類衰老和治療相關疾病
          具有重要應用轉化價值
           
           
          近來,已有多篇文章報道了生物醫學研究數據的激增。到目前為止,基因組測序數據只是其中的冰山一角。研究人員也會不斷產生RNA測序數據、蛋白質組學、單細胞分析、表型(性狀)數據及其他更多類型數據。

          從人類患者本身,到酵母、蠕蟲和果蠅等多種物種,數據從無數的課題和條件中(例如,癌癥中的RNA剪接、涉及阿爾茲海默癥tau紡錘體、2型糖尿病中的胰島功能障礙等)累積。對于小鼠來說,當然也有這種大量數據的累積。

          然而,每個孤立的數據集都無法完全解決研究人員的大多數問題,尤其是對于那些需要更多研究信息的復雜的過程、條件和疾病來說,更是如此。為了加速問題研究進程,有必要從研究跨物種特定問題的不同實驗室收集實驗數據。

          可現實中存在著各種各樣的障礙,如從共享意愿的阻礙因素到不兼容的數據格式,這些障礙都使我們無法充分利用大量涌現的現代數據。
           
           
          GeneWeaver系統
          跨越障礙,整合數據

          GeneWeaver是一套可以克服這些障礙的系統。研究人員可通過該系統整合數據,并使用各種分析工具來解析結果。

          GeneWeaver整合和存儲了實驗性基因組數據,包括:
          ▲ 主要的發表文章
          ▲ 外部數據庫
          ▲用戶提交的數據集

          該數據庫可促進研究人員對跨物種和數據格式的數據以大數據分析的方式進行分析。

          近日,杰克森實驗室的Elissa Chesler教授(博士)和研究員Jason Bubier博士領導的研究小組利用GeneWeaver分析了幾個與老年學問題相關的衰老研究數據,展示了該系統的強大能力。
           

          在發表于PLoS One的一篇文章“Integration of heterogeneous functional genomics data in gerontology research to find genes and pathways underlying aging across species”中,研究人員發現了影響長壽的信號通路和新的保守基因
           
           
          GeneWeaver
          GeneWeaver 是一個異質性功能基因組數據綜合分析平臺,可在全球功能基因組學分析中,對多個物種生物功能相關的基因、基因產物和基因變異,支持用戶比較和對比這些生物功能。
           
           
          衰老相關研究

          在研究人員已開展的衰老相關研究中,包括熱量限制延長壽命的信號通路(已被證明可以延長多種物種的壽命),以及延長特定物種壽命的藥物。將基因組研究中發現的跨物種基因(同源基因)與受Sirolimus-雷帕霉素(小鼠)和3,4,4 ' -三羥基二苯乙烯白藜蘆醇(果蠅)影響的基因進行結合分析,得到了一個涉及所有通路的常見基因HSPA1A。
           
          HSPA1A是HSP70復合體的一部分,之前已被證明與衰老和壽命相關。關注這個特殊的基因將會獲得進一步的研究進展。
           
          該研究小組還整合了來自6個物種(酵母、蠕蟲、果蠅、大鼠、小鼠、人類)的73 個衰老相關基因的數據,用于分析高度保守的衰老相關基因。研究發現,與衰老聯系最緊密的基因 (Cd63) 存在于4個物種的12個基因集中,這為它在衰老機制中的作用提供了強有力的證據。
           
          在與研究人員的合作中,在蠕蟲中敲除了它的同源基因以驗證這一發現,結果觀察到蠕蟲的平均壽命延長了10.5%。盡管尚沒有該基因的變異對人類衰老影響的記錄,但這個結果提示Cd63的作用有待進一步研究。
           
           
          大數據整合與分析的重要性
           
          隨著更多可用數據的產生(包括本文中分析的與衰老相關的功能性基因組數據),大數據的整合和分析將變得越來越重要。

          隨著GeneWeaver數據庫中納入數據集數量和種類的持續增長,其實用性和功能性也在不斷增長。

          未來,數據資源聚合和分析方面的進展將為研究人員對衰老及其他健康和疾病相關過程發現新機制的趨同性分子證據提供便利。
           
           
          源于近百年的專業積累, JAX深知健康優質的小鼠模型對高質量可重復數據的重要性。
           
          JAX在老齡化疾病相關研究領域:
           
          ★ 不僅致力于提供精準可靠模型小鼠——C57BL/6J老齡鼠,憑借專利的GSP控制遺傳漂變和嚴格的GQC控制遺傳質量等特點,可現貨批量供應超高品質最大周齡90周的精準可靠老齡鼠模型,目前已是最被廣泛使用的老齡鼠。
           
          ★ 同樣注重創新性前沿研究:例如, JAX老齡化研究中心和JAX印第安納大學阿爾茨海默癥精準模型中心均已取得了豐碩研究成果。其中,老齡化相關表征信息,也已存儲至JAX小鼠表型信息數據庫MPD( The Mouse Phenome Database ),可供相關研究人員參考使用。
           
           
          JAX老齡化研究
          海量相關信息資源中心

          JAX老齡化研究中心


          JAX小鼠表型組數據庫


          JAX小鼠基因組信息數據庫


           
          相關公司:杰克森艾特生物科技(北京)有限公司
          聯系電話:400-693-5700
          E-mail:orderquest@jax.org.cn


          用戶名: 密碼: 匿名 快速注冊 忘記密碼
          評論只代表網友觀點,不代表本站觀點。 請輸入驗證碼: 8795
          Copyright(C) 1998-2022 中國生物器材網 電話:021-64166852;13621656896 E-mail:info@bio-equip.com
          日本高清视频在线WWW色

              <ol id="pblvd"></ol>
              <cite id="pblvd"></cite>
              <font id="pblvd"><video id="pblvd"></video></font>
              <address id="pblvd"><rp id="pblvd"></rp></address>

                <p id="pblvd"></p>